MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acinetobacter baumannii ATCC 17978 chromosome

Total Repeats: 55075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_009085	TTC	2	6	3971019	3971024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126643463
55002	NC_009085	ATT	2	6	3971077	3971082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126643463
55003	NC_009085	GCA	2	6	3971099	3971104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126643463
55004	NC_009085	CAT	2	6	3971152	3971157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126643463
55005	NC_009085	GGC	2	6	3971164	3971169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126643463
55006	NC_009085	ATG	2	6	3971189	3971194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126643463
55007	NC_009085	AGA	2	6	3971296	3971301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126643463
55008	NC_009085	ATTG	2	8	3971390	3971397	25 %	50 %	25 %	0 %	126643463
55009	NC_009085	TGA	2	6	3971470	3971475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126643463
55010	NC_009085	AAT	2	6	3971477	3971482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126643463
55011	NC_009085	CAAAG	2	10	3971516	3971525	60 %	0 %	20 %	20 %	126643463
55012	NC_009085	ATT	2	6	3971546	3971551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126643463
55013	NC_009085	ATTT	2	8	3971596	3971603	25 %	75 %	0 %	0 %	126643463
55014	NC_009085	GGT	2	6	3971627	3971632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126643463
55015	NC_009085	CAA	2	6	3971648	3971653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126643463
55016	NC_009085	GCCT	2	8	3971894	3971901	0 %	25 %	25 %	50 %	126643464
55017	NC_009085	AAC	2	6	3972023	3972028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126643464
55018	NC_009085	A	6	6	3972153	3972158	100 %	0 %	0 %	0 %	126643464
55019	NC_009085	AACA	2	8	3972170	3972177	75 %	0 %	0 %	25 %	126643464
55020	NC_009085	CT	3	6	3972182	3972187	0 %	50 %	0 %	50 %	126643464
55021	NC_009085	CGTG	2	8	3972292	3972299	0 %	25 %	50 %	25 %	126643464
55022	NC_009085	TTG	2	6	3972415	3972420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126643464
55023	NC_009085	TGC	2	6	3972456	3972461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126643464
55024	NC_009085	GCA	2	6	3972777	3972782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126643464
55025	NC_009085	CAG	2	6	3972844	3972849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126643464
55026	NC_009085	CTT	2	6	3972858	3972863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126643464
55027	NC_009085	AAG	2	6	3972884	3972889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126643464
55028	NC_009085	TAT	2	6	3972970	3972975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126643464
55029	NC_009085	A	7	7	3972998	3973004	100 %	0 %	0 %	0 %	126643464
55030	NC_009085	TCC	2	6	3973194	3973199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126643465
55031	NC_009085	GTT	2	6	3973338	3973343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126643465
55032	NC_009085	TAA	2	6	3973468	3973473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126643465
55033	NC_009085	ATA	2	6	3973477	3973482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126643465
55034	NC_009085	AAT	2	6	3973493	3973498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126643465
55035	NC_009085	TTA	2	6	3973506	3973511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126643465
55036	NC_009085	CAA	2	6	3973522	3973527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126643465
55037	NC_009085	AATAA	2	10	3973560	3973569	80 %	20 %	0 %	0 %	126643465
55038	NC_009085	ACC	3	9	3973586	3973594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126643465
55039	NC_009085	AAT	2	6	3973595	3973600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126643465
55040	NC_009085	GAA	2	6	3973677	3973682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126643465
55041	NC_009085	CAA	2	6	3973690	3973695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126643465
55042	NC_009085	GAAGA	2	10	3973701	3973710	60 %	0 %	40 %	0 %	126643465
55043	NC_009085	AAT	2	6	3973751	3973756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126643465
55044	NC_009085	AACCAG	2	12	3973906	3973917	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	126643465
55045	NC_009085	AAAG	2	8	3973985	3973992	75 %	0 %	25 %	0 %	126643465
55046	NC_009085	CAT	2	6	3974027	3974032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126643465
55047	NC_009085	GAAT	2	8	3974119	3974126	50 %	25 %	25 %	0 %	126643465
55048	NC_009085	T	6	6	3974165	3974170	0 %	100 %	0 %	0 %	126643465
55049	NC_009085	CAC	2	6	3974173	3974178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126643465
55050	NC_009085	ATG	2	6	3974187	3974192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126643465
55051	NC_009085	CAA	2	6	3974212	3974217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126643465
55052	NC_009085	AGA	2	6	3974290	3974295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126643465
55053	NC_009085	TGA	3	9	3975301	3975309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126643466
55054	NC_009085	T	6	6	3975326	3975331	0 %	100 %	0 %	0 %	126643466
55055	NC_009085	AAGATC	2	12	3975445	3975456	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126643466
55056	NC_009085	TAT	2	6	3975621	3975626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126643466
55057	NC_009085	ATA	2	6	3975637	3975642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126643466
55058	NC_009085	TTAT	2	8	3975743	3975750	25 %	75 %	0 %	0 %	126643466
55059	NC_009085	TGA	2	6	3975815	3975820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126643466
55060	NC_009085	TAG	2	6	3975841	3975846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126643466
55061	NC_009085	TTA	2	6	3975873	3975878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126643466
55062	NC_009085	GAT	2	6	3975927	3975932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126643466
55063	NC_009085	T	6	6	3976052	3976057	0 %	100 %	0 %	0 %	126643467
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55065	NC_009085	ATTT	2	8	3976196	3976203	25 %	75 %	0 %	0 %	126643467
55066	NC_009085	CAA	2	6	3976205	3976210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126643467
55067	NC_009085	CTA	2	6	3976223	3976228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126643467
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55069	NC_009085	TTCT	2	8	3976292	3976299	0 %	75 %	0 %	25 %	126643467
55070	NC_009085	GGT	2	6	3976300	3976305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126643467
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55074	NC_009085	TTTA	2	8	3976548	3976555	25 %	75 %	0 %	0 %	126643467
55075	NC_009085	ATG	2	6	3976578	3976583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126643467

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.